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产出成本（costs）是非常关键的绩效指标，但在当前绩效评价中很少被关注与重视。建立合理的产出（outputs）与产出成本概念，在此基础上开展产出成本核算和评价并将评价结果加以实际应用，实为当务之急，无论在组织（政府、部门、机构）还是特定项目或规划层面。考虑到公共组织资源需求的微观基础是产出，尤其如此。
多年来，各级政府与部门之所以很难获得准确可靠的“机关运行成本”信息，主要原因在在于相关法规与文件未能准确定义和清晰区分“投入”、“产出”与“运行”概念。直到今天，关于究竟什么是“机关运行成本”依然存在大量的认知模糊。解释为“保运转的成本”只是表明目的清晰——维持组织日常运营（operating）的维持性成本，但未能表明这一目的之具体内容。
一般地讲，只有在清晰区分“投入成本”与“产出成本”并明了两者逻辑关系的前提下，机关运行成本的确切含义才能被理解，模糊认知才可能得到消除。也唯有如此，把陈旧过时的现行“统计调查法”转向“（权责）会计核算法”，进而建立有意义的产出成本评价与评价结果应用体系，才是可能的。
澄清问题的第一步是把“机关运行成本”划分为两个层次：投入成本与产出成本。
投入成本（input’ costs）指为维持组织运营而在特定期间内发生的资源耗用（“费用”）和资本占用成本，而目的仅仅是为了维持组织本身的“存在”，而不是向组织外部的服务对象提供产出。资本占用成本指占用资产的机会成本。在某些国家，机构需要就其资产占用向政府缴纳资本占用费，这就是资本付费制度。
任何组织都有投入成本，但假如没有产出（“幽灵机构”），即没有产出成本。举例来说，闲置未用的单位公车并无作为产出的行驶里程，也有折旧费和机会成本；无所事事者并无作为产出的“工作时间”，但也有工薪福利支出。产出成本核算的前提是：必须有产出，并且产出必须严格定义、清晰鉴别和正确分类。没有这项扎实的基础工作，政府职能合理化和机构改革很难成功，机构（区别于规划）层面的绩效导向预算也无从谈起。
以上基础工作完成后，接下来即可着手开展产出成本核算——“做事需要花多少钱”。“做事”即把投入转换为产出。没有产出意味着没有做事（磨洋工）。产出成本核算就是把投入成本转换为“做事需要花多少钱”的过程，由此获得的产出成本信息涵盖实际与标准成本、单位成本和总成本。
在此基础上进行的产出成本评价有四项关键应用：
改进运营流程
-产出成本越接近投入成本表明效率越高；
-聚焦次要/无效产出实施成本控制（避免玉石俱焚的一刀切）；
-奖赏把投入成本转换为产出成本并使其控制标准以内的单位。
改进管理决策
-形成正确的成本观（目的才是发生成本的合理基础）；
-服务定价、生产/外包；
-基于产出改进人事（编制数、类型与职责分工）和工薪决策。
改进预算过程
-确立公共组织资源需求的适当微观基础（产出）；
-为预算确立客观的成本基础；
-减少财政部门与机构间支出需求的信息不对称。
促进政府职能合理化
-把形式主义或官僚技能转换为服务意识；
-聚焦资源（花钱）财务观转向产出（为谁为何花钱）财务观；
-基于产出成本量化地方支出责任和评估收入充分性。
